报告题目：用于单分子感知和存储的纳米孔芯片

报告人：李毅

主持人：潘清

报告时间：2024年12月2日 10:00-11:00

报告地点：信息楼D533

摘要：

Reading digital information from highly dense but lightweight DNA medium nowadays relies on time-consuming next-generation sequencing. Nanopore sequencing holds the promise to overcome the efficiency problem, but high indel error rates lead to the requirement of large amount of high quality data for accurate readout. Here we introduce Composite Hedges Nanopores, capable of handling indel rates up to 15.9% and substitution rates up to 7.8%. The overall information density can be doubled from 0.59 to 1.17 by utilizing a degenerated eight-letter alphabet. We demonstrate that sequencing times of 20 and 120minutes are sufficient for processing representative text and image files, respectively. Moreover, to achieve complete data recovery, it is estimated that text and image data require 4× and 8× physical redundancy of composite strands, respectively. Our codec system excels on both molecular design and equalized dictionary usage, laying a solid foundation approaching to real-time DNA data retrieval and encoding.

简介：

李毅研究员，于2019年10月加入南方科技大学，国家级“海外高层次青年人才项目”获得者。2007年和2010年于浙江大学生物医学工程专业生物传感器国家专业实验室获得学士和硕士学位，2015年于比利时天主教鲁汶大学和校际微电子中心（imec）获得博士学位。在比利时校际微电子中心、英国帝国理工学院、德国慕尼黑大学等机构致力于集成电路兼容的光学电学器件（特别是单分子检测芯片）研究十余年，已发表论文50余篇，成果被引用超过2500次，H因子25。主持和参与科技部重点研发项目青年项目各1项，主持国家自然科学基金面上项目1项、广东省自然科学基金重点项目1项等，课题组研究助理教授（博士后阶段）取得国家自然科学基金面上项目和青年项目1项。