报告题目: 非编码RNA编码微蛋白及翻译活性调控的计算分析

报告人: 宋晓峰

主持人: 张贵军

报告时间: 2024年 11月29日 16：00-17：00

报告地点: 信息楼D121

报告摘要：

非编码RNA（ncRNA）一直被认为不具备编码能力，仅能通过自身序列或结构发挥调控功能。然而，随着核糖体测序技术的出现和发展，非编码RNA同样被发现存在核糖体翻译信号。质谱实验则进一步证实，非编码RNA可以翻译产生长度小于100个氨基酸的微蛋白。近来越来越多的证据表明，微蛋白在多种生物学过程中发挥着重要作用，并与多种人类疾病密切相关。目前，非编码RNA中编码微蛋白区域（csORF）的鉴定仍具有挑战性，并且其翻译调控机制也尚不清楚。鉴于此，我们提出了一种新的基于胶囊神经网络模型的计算识别方法csORF-finder，其在微蛋白编码区域识别的准确率、敏感性等方面均显著优于其他方法，并在多个物种上表现出良好的泛化能力。此外，我们对质谱实验证实的可编码微蛋白的lncRNA进行了深入分析，挖掘其与翻译调控相关的序列及结构特征，发现内部核糖体进入位点（IRES）及m7G修饰对lncRNA的编码能力至关重要。最后，针对IRES元件，整合转录组及翻译组测序数据，从翻译失调及反式作用因子互作的角度计算识别出17个肝细胞癌中活性异常的IRES元件，或可作为新型生物标志物。

报告人简介

宋晓峰，教授，博导。南京航空航天大学自动化学院副院长，江苏省“六大人才高峰”高层次人才选拔培养人选。主要研究领域为转录组学与计算系统生物学。近几年来主持国家自然科学基金四项、江苏省重点研发计划项目等各类省部级科研项目十多项。在国际著名的Nucleic Acids Research, Journal of Theoretical Biology, Journal of Medical Virology, BMC Genomics，GPB等SCI检索期刊发表论文80多篇，他引2100多次，H-index 23。目前担任中国人工智能学会生物信息学与人工生命专业委员会常务委员；中国计算机学会生物信息学专业委员会委员；中国自动化学会智能健康与生物信息专委会委员；江苏省生物医学工程学会理事；江苏省生物医学工程学会生物信息学专业委员会主任。