10月22日温州医科大学苏建忠教授学术报告预告
作者:杨细银
发布日期:2020-10-20
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报告时间:10月22日,周四,下午15:30-16:30 报告地点:浙江工业大学信息工程学院D533学术报告厅 报告题目:单细胞转录组的通路活性注释解析癌细胞的起源 报 告 人:苏建忠 组 织 人:张贵军
报告摘要 单细胞转录组测序技术可以从单个细胞的水平分析细胞间的异质性,研究肿瘤微环境,寻找癌细胞的起源等,在传统分析流程中对细胞分群进行功能性解释一直是单细胞转录组解析的一大挑战。通过开发对单细胞进行转录组功能通路注释新方法scTPA,提供在通路水平上对单细胞转录组数据预处理,功能通路活性打分,聚类和细胞类型特异的激活通路挖掘及可视化等系统研究。应用到视网膜母细胞瘤和脑癌等恶性疾病中来挖掘癌细胞的起源,发现基因型驱动的不同癌症表型的差异癌症起源细胞类型,为癌症的精准治疗提供新靶标。
报告人简介 苏建忠,博士,温州医科大学生物医学大数据研究所所长,中国科学院大学温州研究院研究员,国家高层次引进青年人才,浙江省高校领军人才,浙江省杰出青年基金获得者。主持国家自然科学面上项目、国家自然科学重点基金子课题等科研课题。主要从事复杂疾病的遗传和表观遗传数据挖掘,单细胞大数据处理和分析智能算法开发,液体活检分子标志物鉴定等方面的研究工作。开发在线算法工具和数据库10个,发表高水平SCI论文40余篇(累计影响因子300余点)。其中第一或通讯作者在Nature Genetics、Blood、Nature Communications、Genome Biology及Nucleic Acids Research,Bioinformatics等国际高水平期刊发表研究论文12篇,H指数23。获省部级科研奖项2项,多次在国内外学术会议宣讲,参与生物医学信息学论著一项。担任浙江省生物信息学会理事,CCF生物信息专委会委员,中国抗癌协会骨与软组织肿瘤热疗及生物信息专业委员会常务委员,中国抗癌协会肿瘤标志物专业委员会委员等学术职务。 |