报告题目: 抗体-抗原识别与一般蛋白质-蛋白质互作的异同：分子模拟与人工智能研究

报告人: 马步勇

主持人: 张贵军

报告时间: 2023年11月21日  15：00-16：30

报告地点: 信息楼D511

报告摘要：

Antibody is one of the most important immunological molecules and can be engineered as effective biological drugs. We have studied the signal transduction of antibody-antigen recognition, antibody receptor binding, and transmembrane allosteric correlation using molecular dynamic simulations. Antibody- protein antigen interaction is a subset of general protein-protein interaction, sharing similar mechanisms but with distinct special characteristics. Various deep learning approaches were used to predict antibody-antigen interactions. We have shown that an inductive learning model can be demonstrated by learning overall Protein-Protein Interactions from smaller Antibody-Antigen Recognition subset.

报告人简介

  马步勇，上海交通大学长聘教授，博士生导师。1995年获美国佐治亚大学博士学位；1995-1998佐治亚大学博士后，1998年加入美国癌症研究所任资深科学家，2020年回国加入上海交通大学药学院，致力于生物药物设计，结合大规模超级计算和人工智能推动新型药物开发。他在生物大分子动态结构、相互作用和功能方面颇有研究，总结提出了生物分子识别的构象选择（conformational selection）理论，成为与经典的‘Lock-Key’ 和 ‘Induced fit’ 并行的模型。在世界上首次揭示了阿尔兹海默病A淀粉体结构。研究结果在蛋白质结构的动态特性表征，酶催化，蛋白质-蛋白质相互作用和药物设计，神经退行疾病等方面被大量引用，促进了这些领域的发展。多年来发表SCI论文200多篇，谷歌引用22000多次，H-index 67。