近日，我院张贵军教授团队青年教师周晓根在《自然·计算科学》（Nature Computational Science）上发表了题为《冷冻电镜密度图辅助的多域蛋白质结构渐进建模方法》(Progressive assembly of multi-domain protein structures from cryo-EM density maps)的论文。

该研究基于多组学大数据分析和深度学习技术，提出了一种冷冻电镜密度图多域蛋白质结构建模方法，揭示了冷冻电镜数据辅助的蛋白质局部-全局结构渐进建模机理，为高通量基因组规模的大尺寸蛋白质结构建模提供了一种新思路。

该篇论文我院青年教师周晓根为第一作者，密西根大学张阳教授为通讯作者，我院张贵军教授为该论文作者之一。该项研究生获得了国家自然科学基金 (62173304、61773346)和浙江省自然科学基金重点项目(LZ20F030002)等的资助。

作者介绍：周晓根，博士，2018年毕业于浙江工业大学信息工程学院，师从俞立教授和张贵军教授。2018至2021年于密西根大学张阳实验室从事博士后研究工作，2022年聘任为浙江工业大学运河青年学者特聘教授。研究方向为结构生物信息学、计算智能及深度学习。建立了一系列基于抽象凸估计的蛋白质构象空间优化方法，提出了基于类似结构比对的多域蛋白质结构组装方法，并开发了多域蛋白质结构组装服务器 DEMO。开发的DEMO服务器目前已为来自40多个国家的用户组装了3000余个多结构域蛋白。目前已在国内外高水平期刊上发表论文30多篇，其中以第一作者在国际综合性期刊《美国科学院院刊》(PNAS)，Nature子刊 (Nature Protocols、Nature Computational Science) 以及Nucleic Acids Research、IEEE Transactions on Evolutionary Computation、IEEE Transactions on Cybernetics等权威期刊上发表论文12篇。

在线服务器地址：https://zhanggroup.org/DEMO-EM/

论文链接：

https://www.nature.com/articles/s43588-022-00232-1