科技创新2030-“新一代人工智能”重大项目研讨会暨 AI蛋白质科学学术报告预告
作者:学院办公室 发布日期:2024-09-18 浏览次数:

时间:2024.9.20 星期五

地点:浙江工业大学信息工程学院信息楼D121

会议安排

研讨交流环节

13:30-14:30

研讨内容

针对蛋白质重大科学研究问题,研讨重大疾病和药物研发关键的蛋白质AI预测、设计技术及前沿科学问题。


参会人员

李子青(西湖大学)、刘沛东(西湖大学)、原发杰(西湖大学)、林涛(西湖大学)、张贵军(浙江工业大学)、周晓根(浙江工业大学)

学术报告环节

14:30-15:00

报告1:基于人工智能的蛋白质计算体系架构

及关键技术

报告人:李子青

西湖大学

15:00-15:30

报告2冷冻电镜蛋白质多构象动态结构解析

报告人:刘沛东

西湖大学

15:30-15:40

中场休息

15:40-16:10

报告3基于序列-结构的氨基酸突变致癌性预测

报告人:原发杰

西湖大学

16:10-16:40

报告4蛋白质序列-结构关系深度变换及蛋白质靶标药物设计

报告人:林涛

西湖大学

报告人信息及摘要

李子青个人简介:

李子青(Stan Z. Li, IEEE Fellow,西湖大学人工智能讲席教授,曾任微软亚洲研究院lead researcher、中科院自动化所模式识别国家重点实验室资深研究员。研究方向为AI基础研究,包括图/序列/多模态表征学习、自监督学习、生成模型、预训练方法;AI for Science研究,包括AI+生命科学、AI+合成生物学等。发表论文500余篇,著作10部,Google Scholar引用67000余次,World Scientist and University Rankings 2024计算机学科中国区排名第2。领导开发了世界上第一个实时人脸识别系统,比尔盖茨接受CNN采访亲自为之讲解;设计研发了多个国家级人脸识别系统,并落地实施应用。曾任AI顶级期刊IEEE TPAMI等刊物副主编,担任100余个国际学术会议大会主席、程序主席,或程序委员。加入西湖大学后,负责实施科技部新一代人工智能重大项目2项、国家自然科学基金区域重点项目(AI+生命科学)1项。

 

报告摘要:

基于拓扑几何、深度学习技术框架和大数据,研究复杂模式空间之间的深度流形变换(DMT)方法;基于DMT和蛋白质的生物物理化学特性、蛋白质序列-结构折叠原理,训练氨基酸序列-蛋白质结构-蛋白质功能之间非线性变换模型;构建全新自主的人工智能核心技术体系,揭示蛋白质序列-结构-功能复杂关系,解决蛋白质结构预测(从氨基酸序列到蛋白质三维结构),蛋白质设计(给定蛋白质结构,设计对应的氨基酸序列)和药物研发三大领域的关键问题。

刘沛东个人简介:

刘沛东,于2012年和2015年在新加坡国立大学分别获得电子工程专业本科和硕士学位。随后,加入苏黎世联邦理工学院(ETH Zurich)计算机视觉和几何实验室(Computer Vision and Geometry Lab)攻读博士,并于2021年获得计算机科学专业科学博士学位。于2021年底正式加入西湖大学工学院,独立创建西湖大学计算机视觉和几何深度学习实验室Computer Vision and Geometric Learning Lab)。该实验室主要研究方向为:1)三维计算机视觉;2)机器人三维环境感知;3)几何深度学习及其在计算机视觉、生命科学和其它学科的应用。已在计算机视觉,机器人领域的国际期刊和会议发表研究论文20余篇。主要代表性研究成果为基于多相机的即时定位和建图,在恶劣环境下的相机运动估计和三维稠密建图等。刘沛东博士是多个国际顶级期刊和会议的审稿人(比如TPAMI, IJCV, RA-L, CVPR, ICCV, 3DV, IROSICRA等)。刘沛东博士曾获得一系列奖项,其中包括Dean’s list (新加坡国立大学),关肇直最佳论文奖,多次获得国际空中机器人比赛第一名等奖项。

报告摘要:

针对复合物蛋白质结构解析问题,结合二维电镜图像和深度学习算法研究适用于冷冻电镜技术的复合物蛋白质结构解析的新理论与新方法,构建基于二维图像到三维电镜密度图、三维电镜密度图到复合物原子结构的动态预测模型,实现具有高精度、可扩展性与可解释性的蛋白质动态结构解析算法。

原发杰个人简介:

原发杰,2018年毕业于英国格拉斯哥大学,获计算机博士学位,博士期间曾在西班牙Telefonic Research与新加坡国立大学从事研究工作。2019-2021就职于腾讯,任职机器学习高级研究员。20214月加入西湖大学,任工学院特聘研究员,从事AI大模型与计算生物学相关研究。原发杰博士以一作、共一、通讯作者身份在机器学习与人工智能相关顶会顶刊(NeurIPSICLRUAISIGIRWWWWSDMCIKMACLIJCAIICDETKDETPAMI 以及Molecular Cell)发表学术论文30余篇,曾获ICTAI2016最佳学生论文,腾讯工作期间授权AI专利十余项,多项科研成果及专利等核心技术LambdaFMCIKM2016NextItNetWSDM2019),PeterRecSIGIR2020)被应用于大规模工业检索和推荐系统,具有较好的业界影响力。在西湖大学致力于AI大模型研究,实验室发表了多项AI大模型相关研究成果,包括蛋白质大语言模型发表在ICLRNeurIPS以及Molecular Cell,以及推荐系统相关大模型基准建设,发表在SIGIRWSDMICDENeurIPSSDMTPAMI等。

报告摘要:

通过人工智能手段探究癌症蛋白突变对癌变过程的影响,识别高风险突变癌症蛋白,并在此基础上,结合患者病理信息,对患者致癌蛋白的突变进行致病性预测、对肿瘤的发展情况进行评估。

林涛个人简介:

林涛,2014年毕业于浙江大学电气工程学院,并分别于2017年和2022年在瑞士洛桑联邦理工学院(EPFL)获得硕士与博士学位。林涛博士于202211月正式加入西湖大学工学院,任特聘研究员、助理教授、博士生导师,并独立创建西湖大学学习与推理系统实验室Learning and INference Systems LINsLaboratory)。研究领域为深度学习与优化和分布式深度学习与推理系统,相关成果达20余篇论文,其中以一作/共同一作身份在顶级机器学习会议如ICML/NeurIPS/ICLR上发表论文10余篇。根据谷歌学术统计,论文引用达2500余次(截至202308月),H指数20

报告摘要:

基于结构生物学和生物统计力学领域知识,研究新一代AI蛋白质计算关键科学问题和关键技术问题,突破蛋白质多域、多构象和复合物结构预测与设计挑战难题,建立新一代蛋白质计算基础理论。